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墾丁遺址
中央研究院歷史語言研究所
‧ 墾丁史前遺址依目前的地理環境來說，位於石牛溪下游，離出海口處約700~1000公尺段的東側廣大河階緩坡地上。地質構造上，以隆起珊瑚礁石灰岩台地為主。遺址占地面積約10公頃。墾丁遺址最早在1930年，被宮本延人發現。隨後由宮本延人、移川子之藏和宮原敦等進行過3次發掘。
圓山遺址
中央研究院歷史語言研究所
‧ 圓山遺址的考古遺留遍及高程海拔3~35.6公尺。根據金關丈夫與國分直一（1950年）發表的〈臺灣考古學研究簡史〉內容顯示，圓山遺址是1897年（明治30年)3月7日，伊能嘉矩和宮村榮一在附近進行地表調查時，發現大量貝殼遺留，並推斷這些遺留應是古代人類食用後的堆積，始稱「圓山貝塚」。
鳳鼻頭遺址
中央研究院歷史語言研究所
‧ 鳳鼻頭遺址，早先稱為「中坑門遺址」，是金子壽衛男在1940年調查貝塚遺跡時發現的。1943年國分直一曾到此田野調查。但另有資料顯示，遺址文化層堆積的揭露，是坪井清足在此地服兵役，因挖掘作戰防禦工事而發現的。根據坪井氏當初的認識，這裡的陶器能歸類有：紅陶、彩陶、黑陶和褐色陶。
營埔遺址
中央研究院歷史語言研究所
‧ 早期營埔村落與渡船頭聚落之間，烏溪堤防以北至鐵道的附近地區。營埔遺址最早在1943年時，由國分直一發現；發現之初，從遺址地表採集得黑陶，隨即認為與中國大陸北方出土的黑陶文化關係密切。因此，1944年間就規畫進行了3次的考古試掘；劉茂源先生也在1947年夏天，從遺址上採集得彩陶和石刀。
苑裡遺址
中央研究院歷史語言研究所
‧ 苑裡遺址最早在1935年由丹桂之助所發現，當時稱為「苑裡貝塚」。1946至1947年期間，劉茂源博士跟隨國分直一與金關丈夫教授於此處的考古田野調查與發掘，並於1950年發表〈新竹縣「苑裡貝塚」之貝類分布〉。
杉原遺址
中央研究院歷史語言研究所
位在台11公路真砂橋北產業道路附近。文化年代上屬於東部新石器時代中期至晚期的富山文化及麒麟文化。劉茂源博士在此地表採集有1件石子器。此種器物常見於恆春半島墾丁遺址和鵝鑾鼻I和II遺址。
芝山岩遺址
中央研究院歷史語言研究所
‧ 位在臺北盆地邊緣的砂岩小丘，小丘高程由海拔7至40公尺不等，整座小丘可視為臺灣島嶼地質變遷史的自然教室。遺址分布的範圍涵蓋整座小丘及四周低平地上，號稱是全臺灣第一處被發現的史前考古遺址。早在1896年，日本總督府在此設立學堂做為普及教育之所。一學校教師粟野傳之丞在附近採集得一石斧而得名。
都蘭遺址
中央研究院歷史語言研究所
‧ 都蘭遺址以巨型石棺、石壁遺存在地表而視為東部巨石文化的內涵及年代。2006年臺東縣政府已公告為「縣定遺址」，並將地表上的遺存分別設置石壁區和岩棺區，以便維護和保存。
‧ 劉茂源博士留存的影像資料亦屬岩棺和石壁的拍攝。遺址現況大致上與當年所觀察的變化不大。
十三行遺址
中央研究院歷史語言研究所
‧ 十三行遺址是1957年空軍飛行員潘克永，因每次飛越該地上空時，飛機羅盤總出現異常反應，於是拜訪了林朝棨教授，現地會勘後，確認是一處考古遺址。1959年時，時任國立臺灣大學考古人類學系的石璋如教授，帶領同學來遺址進行考古發掘。
劍潭遺址
中央研究院歷史語言研究所
‧ 此遺址似乎應該稱為「劍潭山」遺址，而不是「劍潭」遺址。根據記載，1897年發現「圓山貝塚」之後，10月間鳥居龍藏進行調查時，經當時的圓山公園主任安井氏告知在基隆河對岸劍潭山山坡斷面上亦發現有貝塚的遺留堆積。此為劍潭遺址發現的最早記錄。古稱大直庄土名劍潭，大直山亦稱劍潭山。